09:03: Lima pembajak menabrakkan Penerbangan 175 ke lantai 77 hingga 85 Menara Selatan. Semua orang di dalam pesawat tewas, begitu juga sejumlah orang di dalam gedung. Dua dari tiga tangga darurat tidak dapat dilewati dan sebagian besar kabel lift terputus, menjebak banyak orang di atas zona tumbukan dan di dalam lift.
09:03: Panggilan kedua untuk mobilisasi membuat jumlah total petugas Departemen Kepolisian Kota New York yang mendatangi tempat kejadian menjadi sekitar 2.000. Selain itu, FDNY mengeluarkan alarm kelima dan mengerahkan beberapa ratus petugas pemadam kebakaran tambahan ke tempat kejadian.
09:05: Presiden Bush diberitahu bahwa pesawat kedua telah menabrak World Trade Center.
09:12: Pramugari Rene A. May menelepon ibunya dan mengatakan kepadanya bahwa pembajak telah menguasai Penerbangan 77. Ketika panggilan May terputus, dia menelepon American Airlines.
09:30: Di tengah laporan tentang pesawat yang dibajak, Kantor Manajemen Darurat Walikota di 7 World Trade Center dievakuasi.
09:37: Pembajak menabrakkan Penerbangan 77 ke Pentagon. Semua 53 penumpang dan enam awak tewas, dan 125 personel militer dan sipil di darat tewas dalam kebakaran yang disebabkan oleh seramgan itu.
09:42: Badan Penerbangan Federal melarang semua penerbangan, memerintahkan semua pesawat sipil di wilayah udara Amerika Serikat untuk mendarat. Keberangkatan juga dilarang.
09:45: Evakuasi di Gedung Putih dan US Capitol dimulai. Baik DPR maupun Senat sedang bersidang saat evakuasi dimulai.
09:58: Penerbangan 93 terbang sangat rendah ke tanah sehingga penumpang Edward P. Felt dapat menghubungi operator darurat 911 di Westmoreland County, Pennsylvania.
09:59: Menara Selatan runtuh setelah terbakar selama 56 menit. Menara runtuh hanya dalam 10 detik.
09:59: Prosedur kontinuitas pemerintahan diterapkan untuk pertama kalinya dalam sejarah Amerika.
10:03: Empat pembajak menabrakkan Penerbangan 93 ke sebuah lapangan dekat kota Shanksville, Pennsylvania. Semua 33 penumpang dan tujuh awak tewas. Penumpang dan awak telah menyerbu kokpit, dan pesawat akhirnya jatuh hanya 20 menit sebelum Washington, D.C.
10:15: Gedung E Pentagon runtuh.
10:28: Menara Utara WTC runtuh setelah terbakar selama 102 menit. Lebih dari 1.600 orang tewas akibat serangan di Menara Utara.
11:02: Walikota New York City Rudolph Giuliani mendesak evakuasi Manhattan.
12:16: Penerbangan terakhir masih di udara di atas daratan Amerika Serikat. Dalam dua setengah jam, wilayah udara AS telah dibersihkan dari sekitar 4.500 pesawat komersial dan penerbangan umum.